Dokuz Eylül Üniversitesi Onkoloji Enstitüsü’nün misyonu;  Sağlık konusundaki en önemli sorunlardan biri olan kanser hastalığının sebeplerinin belirlenmesi, önlenmesi, çağdaş  yöntemlerle erken tanı  sağlanması güncel yaklaşımlarla tedavi edilmesi bu konuda bilgi ve ileri teknoloji ile araştırmalar gerçekleştirilmesi ve üst düzey donanımlı eğitilmiş bilim insanı yetiştirilmesidir.